RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489476.5

TPRKB-209, Transcript of TP53RK binding protein, human

TSL 5

Gene TPRKB, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRKB-209	ENST00000489476	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	VCY	O14598	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	FABP1	P07148	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	HRH1	P35367	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	HTR2B	P41595	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	TCL1A	P56279	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	HERV-K104	P61576	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	GNG2	P59768	71 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476		Q8TAT8	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRKB-209	ENST00000489476	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	MT3	P25713	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	S100A7	P31151	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	LEP	P41159	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	GPR82	Q96P67	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	PTHLH	P12272	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	GABRB1	P18505	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	S100G	P29377	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	OR10J4	P0C629	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CRYGA	P11844	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CCR6	P51684	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	MEF2D	Q14814	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	MYL12B	O14950	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	GABARAP	O95166	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CXCL3	P19876	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	ZNF90	Q03938	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	C7orf71	A4D174	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	PRSS1	P07477	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	AKR1C2	P52895	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	TAS2R20	P59543	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRKB-209	ENST00000489476	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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