RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	HTN3	P15516	51 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01587	Q99440	93 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	NEU1	Q99519	415 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SSR4-208	ENST00000471880	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	OR7C2	O60412	319 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	PRM2	P04554	102 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	FCN2	Q15485	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880		A8MTW9	85 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	OR10J4	P0C629	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN1B	P46527	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880		M0R3E3	92 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	TSPO	P30536	169 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	DAD1	P61803	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	ICAM4	Q14773	271 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	DKK2	Q9UBU2	259 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF253	O75346	499 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB130B	P0DP73	79 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB130A	P0DP74	79 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	LEP	P41159	167 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	ERCC8	Q13216	396 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPV4	95 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB4	O95168	129 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	AZU1	P20160	251 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TCTA	P57738	103 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	PDE6H	Q13956	83 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R45	P59539	299 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880		H7BYZ3	331 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	CSN1S1	P47710	185 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R60	P59551	318 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF266	Q14584	549 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf74	Q96GX8	76 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	RAB2A	P61019	212 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	LYRM9	A8MSI8	78 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	M6PR	P20645	277 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880		Q5BKY6	102 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SSR4-208	ENST00000471880	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.54	□□□□□ -0.72

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