RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 SEC11CQ9BY50 192 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 BCL2L14Q9BZR8 327 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 OR2H1Q9GZK4 316 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 BANF2Q9H503 90 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 C11orf1Q9H5F2 150 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TUBA4BQ9H853 241 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 OR5AC2Q9NZP5 309 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 AK3Q9UIJ7 227 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 DKKL1Q9UK85 242 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 POLR1DQ9Y2S0 133 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 MPC1Q9Y5U8 109 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 FAM186AA6NE01 2351 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PRR14LQ5THK1 2151 aa1.13□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 VPS13AQ96RL7 3174 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 A0A0G2JMM0 328 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 A0A1W2PPB8 328 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 A0A1W2PRS3 328 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PQLC2LA1A4F0 135 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 KIR3DP1A8MWS1 328 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 FAM25EA8MYX2 175 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 UMAD1C9J7I0 102 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 GPR31O00270 319 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CDIPTO14735 213 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TCF21O43680 179 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PITX3O75364 302 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CA2P00918 260 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PPYP01298 95 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 IFNA21P01568 189 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 APOC3P02656 99 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CSN2P05814 226 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF728P0DKX0 622 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CGB3P0DN86 165 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CGB7P0DN87 165 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 ADCYAP1P18509 176 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CNTFRP26992 372 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SNCAP37840 140 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 LPAR6P43657 344 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PIGPP57054 158 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM33P57088 247 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TAS2R30P59541 319 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 RAB2AP61019 212 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 GNG3P63215 75 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CD164Q04900 197 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TNFRSF9Q07011 255 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SMCO1Q147U7 214 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 RSU1Q15404 277 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 OR8G1Q15617 311 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 HMGN3Q15651 99 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 MSMO1Q15800 293 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PIGYQ3MUY2 71 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 NMSQ5H8A3 153 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 FAM74A1Q5RGS3 127 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 DPPA3Q6W0C5 159 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 Q6ZT83 130 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 C6orf201Q7Z4U5 140 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 Q8IYB0 196 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf174Q8IYL3 243 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SVBPQ8N300 66 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM251Q8N6I4 163 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 LFNGQ8NES3 379 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 OR4A5Q8NH83 315 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 FNDC9Q8TBE3 224 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 CT55Q8WUE5 264 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 MALSU1Q96EH3 234 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 FAAP24Q9BTP7 215 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM222Q9H0R3 208 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TLNRD1Q9H1K6 362 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 OR2D2Q9H210 308 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 OR51I2Q9H344 312 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 NAA60Q9H7X0 242 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 TAF9BQ9HBM6 251 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF286AQ9HBT8 521 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SPACA1Q9HBV2 294 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 SLC2A9Q9NRM0 540 aa1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
PTPRC-208ENST00000427110 UQCC1Q9NVA1 299 aa1.12□□□□□ -2.23
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