RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
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PGGT1B-203ENST00000419445 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1B-203ENST00000419445 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.8□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1B-203ENST00000419445 CD7P09564 240 aa2.79□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
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PGGT1B-203ENST00000419445 NOTCH1P46531 2555 aa2.79□□□□□ -1.96
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PGGT1B-203ENST00000419445 SAP30O75446 220 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 AMN1Q8IY45 258 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB123Q8N688 67 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 HIGD1BQ9P298 99 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GW15 77 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R2Z0 102 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
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