RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 GLMPQ8WWB7 406 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa16.52■□□□□ 0.23
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC50A1Q9BRV3 221 aa16.51■□□□□ 0.23
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SH3BP5-204ENST00000412806 GFI1BQ5VTD9 330 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF152Q8N8N0 203 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 OR4B1Q8NGF8 309 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 OR2D3Q8NGH3 330 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 FAM181BA6NEQ2 426 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR73Q6P4I2 378 aa16.41■□□□□ 0.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 ESM1Q9NQ30 184 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 SMPXQ9UHP9 88 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 CT45A10P0DMU9 189 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 GZMBP10144 247 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 PDZD11Q5EBL8 140 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 HIST3H2BBQ8N257 126 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 SELENOKQ9Y6D0 94 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A087WW49 117 aa16.4■□□□□ 0.22
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