RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 FA2HQ7L5A8 372 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 NPBQ8NG41 125 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 VGLL1Q99990 258 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 COX11Q9Y6N1 276 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 ST20Q9HBF5 79 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 VPS13CQ709C8 3753 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 PRAC2D3DTV9 90 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 ERCC8Q13216 396 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 PET117Q6UWS5 81 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF747Q9BV97 191 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPR1 153 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 IGHG4P01861 327 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM11P17152 192 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 CTSGP08311 255 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 CSN1S1P47710 185 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2V1Q13404 147 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 TWIST1Q15672 202 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 RAXQ9Y2V3 346 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRR-202ENST00000342084 MED13LQ71F56 2210 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRR-202ENST00000342084 PDE6HQ13956 83 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRR-202ENST00000342084 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRR-202ENST00000342084 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.64□□□□□ -1.51
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