RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 OR4C46A6NHA9 309 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 G0S2P27469 103 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 C15orf32Q32M92 178 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 SAA4P35542 130 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 GAGE1Q13065 139 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 HSPB8Q9UJY1 196 aa13.45□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 RAB9AP51151 201 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 PET117Q6UWS5 81 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 TPPP3Q9BW30 176 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ZFAND3Q9H8U3 227 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 U3KQK5 164 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 A0A087X0K7 114 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ATP6V0E1O15342 81 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 RHOGP84095 191 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 VGLL1Q99990 258 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ST20Q9HBF5 79 aa13.44□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 DLEU1O43261 78 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC3BP05452 202 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 CSN3P07498 182 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 SFTPCP11686 197 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 GPR183P32249 361 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 BMI1P35226 326 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 BUB3O43684 328 aa13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 LY6DQ14210 128 aa13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ECSCRQ19T08 205 aa13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 STPG4Q8N801 248 aa13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.42□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM213A2RRL7 107 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 NPFFO15130 113 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF124Q15973 351 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF575Q86XF7 245 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 HLA-DMBP28068 263 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 TFPI2P48307 235 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 Q8TAT8 98 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC140Q96MF4 163 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.41□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.4□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 GOSR1O95249 250 aa13.4□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 IGLC6P0CF74 106 aa13.4□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 LINC01545Q5VT33 79 aa13.4□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 FA2HQ7L5A8 372 aa13.4□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.4□□□□□ -0.26
CLDN11-201ENST00000064724 LINC01548A6NM66 108 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 D6R8Y8 96 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF747Q9BV97 191 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 WNK2Q9Y3S1 2297 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 RBAKDNA6NC62 111 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 G3V318 75 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 AMN1Q8IY45 258 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 PRORYQ9H606 182 aa13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 ORMDL3Q8N138 153 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 MED13LQ71F56 2210 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 hDV102S1A0JD36 115 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 PRELID3AQ96N28 172 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 CNFNQ9BYD5 112 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.38□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.37□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 C19orf84I3L1E1 186 aa13.37□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 A0A096LNJ9 63 aa13.37□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.37□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.36□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 PRAC2D3DTV9 90 aa13.36□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 PAX8Q06710 450 aa13.36□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 ATP6V0BQ99437 205 aa13.36□□□□□ -0.27
CLDN11-201ENST00000064724 NPSP0C0P6 89 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms