RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gins3Q9CY94 216 aa8.54□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa8.54□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SelenokQ9JLJ1 94 aa8.54□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv5-2A0A0A6YVX8 117 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smim17A0A504 109 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp972A2AW65 139 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11563B1AQ90 168 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15130F6PYN5 206 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1121L7MTT1 314 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifna1P01572 189 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoxa1P09022 331 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfsf8P32972 239 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpne2P59108 548 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC100530Q497J0 97 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr141Q60880 325 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HrasQ61411 189 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r26Q8R2D7 339 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nit1Q8VDK1 323 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem267Q8VDR5 215 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr981Q8VEU2 310 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1454Q8VFW2 307 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr979Q8VH10 311 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mogat1Q91ZV4 335 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpp25lQ99JH1 163 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tomm40lQ9CZR3 308 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krtap4-7Q9D732 168 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9D8N1 392 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acox3Q9EPL9 700 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Praf2Q9JIG8 178 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1255A2AUA4 310 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr19B2RW88 366 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15440D3Z3P4 90 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf212bD3Z423 297 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm17657E9PWY5 170 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21974F6W3F3 119 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aldh3b3J3QMK6 479 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Degs1O09005 323 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd200O54901 278 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SncaO55042 140 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gfi1bO70237 330 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sult2a1P52843 285 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RhogP84096 191 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1428Q0VDY1 314 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4951Q3UED7 406 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam71f1Q3UZD7 341 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra4Q60651 263 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gnb3Q61011 340 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifna13Q80SU4 189 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scrt2Q8BTH6 311 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agpat2Q8K3K7 278 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gng10Q9CXP8 68 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9230104L09RikQ9D264 133 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PipoxQ9D826 390 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr27Q9EQ90 311 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl39Q9JKF7 336 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PthQ9Z0L6 115 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aifm1Q9Z0X1 612 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr573-ps1A0A1B0GRU2 297 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5519D3Z175 170 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly6lH3BJG9 140 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P04212 136 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pet117P0DJF2 80 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab17P35292 214 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab3cP62823 227 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm815Q3UWS2 115 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr149Q60888 311 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxc2Q61850 494 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alkbh2Q6P6J4 239 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1434Q7TQR9 312 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Poc1bQ8BHD1 476 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tsen54Q8C2A2 525 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MrgprfQ8VCJ6 343 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr790Q8VGJ3 322 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rsl24d1Q99L28 163 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl27Q99N92 148 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap3s1Q9DCR2 193 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r48Q9EQ52 302 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr944Q9EQ91 311 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cx3cr1Q9Z0D9 354 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mbd2Q9Z2E1 414 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stab2Q8R4U0 2559 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OdamA1E960 273 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr613E9PYB4 317 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10251J3QPM5 127 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr50O88495 591 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phxr5P08399 672 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cxcl1P12850 96 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GipP48756 144 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cox7a2P48771 83 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.4 ms