RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SNURFLB1AK76 121 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS46E5RG02 174 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BP45 60 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 HYPMO75409 117 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TMED4Q7Z7H5 227 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 FRZBQ92765 325 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 DIRAS2Q96HU8 199 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CTDSPLO15194 276 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNGR2O43760 224 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 Q5VSD8 79 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPD1Q8N2G4 141 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00612Q8N6U2 182 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087X0K7 114 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00869P0C866 280 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 VAMP1P23763 118 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVFC1-1P60608 527 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR3DS1Q14943 382 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC190Q86UF4 302 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf144Q9BQM9 153 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BNG1 76 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A7AQ86SG5 101 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 J3KRW8 73 aa18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A6P12236 298 aa18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RABL2BQ9UNT1 228 aa18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 XGP55808 180 aa18.81■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 GFI1BQ5VTD9 330 aa18.81■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 FAT1Q14517 4588 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SIVA1O15304 175 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CDPF1Q6NVV7 123 aa18.8■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNA5P01569 189 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM128Q5BJH2 165 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL6Q9H0F7 186 aa18.79■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV2A0A075B6R0 118 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A096LPF7 62 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PMS2P5A8MQ11 134 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB5P09067 269 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SELENOTP62341 195 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 LCN15Q6UWW0 184 aa18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PLP1P60201 277 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZTI0 123 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 LRTM2Q8N967 370 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC50A1Q9BRV3 221 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF24Q9Y225 148 aa18.77■□□□□ 0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL2P19875 107 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 VSIG2Q96IQ7 327 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ARV1Q9H2C2 271 aa18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 FAUP35544 74 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SPCS2Q15005 226 aa18.75■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BTX0 84 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 NXPH4O95158 308 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PSENENQ9NZ42 101 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAC2D3DTV9 90 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH10OSP0CZ25 163 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 LEPP41159 167 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PATE2Q6UY27 113 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SFT2D2O95562 160 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-1P60331 282 aa18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCBP2O75592 4640 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R1AQ13522 171 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PYGO2Q9BRQ0 406 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MDFICQ9P1T7 246 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC17A3O00476 420 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM18P0DKX4 95 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ICAM4Q14773 271 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00305Q7Z4B0 112 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 NFE4Q86UQ8 179 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 C18orf15Q96N68 181 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 MGAT4CQ9UBM8 478 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ICOSQ9Y6W8 199 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa18.69■□□□□ 0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SSSCA1O60232 199 aa18.69■□□□□ 0.58
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