RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A087X0K7	114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	MED6	O75586	246 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	IAPP	P10997	89 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	RAP2B	P61225	183 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864		J3QL48	77 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC25A6	P12236	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	ANXA3	P12429	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TNNI3-208	ENST00000589864	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A087WTM6	91 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	HYPM	O75409	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	PLP1	P60201	277 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	AKR1C1	Q04828	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	S100A7A	Q86SG5	101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	IL5	P05113	134 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	RNF24	Q9Y225	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	CTDSPL	O15194	276 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	SYNGR2	O43760	224 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	NXPH4	O95158	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	GCSH	P23434	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864		Q6ZSN1	163 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864		Q6ZTI0	123 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	WRB	O00258	174 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	OR5G3	P0C626	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	CXCL2	P19875	107 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	SELENOT	P62341	195 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	FAT1	Q14517	4588 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	LINC00869	P0C866	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	CTF1	Q16619	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864		K7EP13	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	RGS5	O15539	181 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TNNI3-208	ENST00000589864	CTDSP2	O14595	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	PAX4	O43316	350 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	LEP	P41159	167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	IL18	Q14116	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	MCUB	Q9NWR8	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	FUT9	Q9Y231	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TNNI3-208	ENST00000589864	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms