RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572557.5

AKAP1-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AKAP1, Length 3,098 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-208ENST00000572557 HARBI1Q96MB7 349 aa9.52□□□□□ -0.89
AKAP1-208ENST00000572557 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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AKAP1-208ENST00000572557 KLRD1Q13241 179 aa9.51□□□□□ -0.89
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AKAP1-208ENST00000572557 ZMAT4Q9H898 229 aa9.51□□□□□ -0.89
AKAP1-208ENST00000572557 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.51□□□□□ -0.89
AKAP1-208ENST00000572557 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.51□□□□□ -0.89
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AKAP1-208ENST00000572557 TAL2Q16559 108 aa9.45□□□□□ -0.9
AKAP1-208ENST00000572557 PSMG4Q5JS54 123 aa9.45□□□□□ -0.9
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AKAP1-208ENST00000572557 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.44□□□□□ -0.9
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AKAP1-208ENST00000572557 IGKV3-15P01624 115 aa9.44□□□□□ -0.9
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AKAP1-208ENST00000572557 TWIST1Q15672 202 aa9.44□□□□□ -0.9
AKAP1-208ENST00000572557 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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