RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550020.6

TMEM116-209, Transcript of transmembrane protein 116, human

TSL 4

Gene TMEM116, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM116-209	ENST00000550020	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	C14orf144	Q96I85	54 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	METTL26	Q96S19	204 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	AKAP13	Q12802	2813 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020		A0A1B0GUS0	222 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	C20orf202	A1L168	122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020		M0R2Z0	102 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	CLEC3B	P05452	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	GPR183	P32249	361 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	LINC00310	P59036	64 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020		S4R3C0	116 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	TNC	P24821	2201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	VWC2L	B2RUY7	222 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	SLC25A16	P16260	332 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	NTF3	P20783	257 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	ATP5J2	P56134	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	USMG5	Q96IX5	58 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TMEM116-209	ENST00000550020		B4DSR2	109 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	BUB3	O43684	328 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	IGHV3-23	P01764	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	IGF1	P05019	195 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	MSMB	P08118	114 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	NIT1	Q86X76	327 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	RCHY1	Q96PM5	261 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	PRR25	Q96S07	402 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ASCL2	Q99929	193 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	FRY	Q5TBA9	3013 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		A0A0G2JLM5	398 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		F2Z2F3	143 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		M0R143	59 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		M0R3E3	92 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	SH2D1A	O60880	128 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	LINC00614	P0C842	121 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	FBLN7	Q53RD9	439 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	LCN12	Q6JVE5	192 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ZNF580	Q9UK33	172 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		J3QLI3	93 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	NDUFA4	O00483	81 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	TRGV3	P03979	118 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	C3orf79	P0CE67	100 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		A6NDX4	124 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020		G3V318	75 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	IGHG2	P01859	326 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	PPBP	P02775	128 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ARL3	P36405	182 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	CTRL	P40313	264 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TMEM116-209	ENST00000550020	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3

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