RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 D6R8Y8 96 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 NCR2O95944 276 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 SEC11AP67812 179 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 PSG9Q00887 426 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 PDE6HQ13956 83 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 NHLH1Q02575 133 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 ORMDL3Q8N138 153 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 PRELID3AQ96N28 172 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 C8orf49Q96NF6 230 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 CST9LQ9H4G1 147 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 C7orf71A4D174 169 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 B9A039 149 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R3E3 92 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 GNG7O60262 68 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 U3KQK5 164 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LY6LH3BQJ8 138 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 TIMM23O14925 209 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 KLK10O43240 276 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 SNAI2O43623 268 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 PPBPP02775 128 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 GFRALQ6UXV0 394 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 NBR2O15453 112 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 SH2D1AO60880 128 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM106CPP0CH98 169 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 COTL1Q14019 142 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A096LNJ9 63 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM213A2RRL7 107 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 HBDP02042 147 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 AMN1Q8IY45 258 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 A6NDN8 102 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 CD3EP07766 207 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 LYNX1P0DP58 116 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 MFAP4P55083 255 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 AP1S3Q96PC3 154 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 VPS25Q9BRG1 176 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-202ENST00000546471 FGF6P10767 208 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CACNG7P62955 275 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 S4R3C0 116 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 GAGE12BA1L429 117 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CKS2P33552 79 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 RABAC1Q9UI14 185 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CEACAM3P40198 252 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 UQCRFS1P47985 274 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 TWIST1Q15672 202 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NPBQ8NG41 125 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 DPM3Q9P2X0 92 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 A1L4Q6 167 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 GAGE10A6NGK3 116 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 K7ERU9 68 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 SCGB2A1O75556 95 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFA3O95167 84 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 BMI1P35226 326 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 HSD52Q0P140 79 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXE3Q13461 319 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms