RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 RAB11AP62491 216 aa9.37□□□□□ -0.91
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PTPRU-209ENST00000526080 NFE4Q86UQ8 179 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRU-209ENST00000526080 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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PTPRU-209ENST00000526080 DISC1C4P0D8 188 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRU-209ENST00000526080 CXCL2P19875 107 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRU-209ENST00000526080 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
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PTPRU-209ENST00000526080 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRU-209ENST00000526080 ATP6V1G2O95670 118 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRU-209ENST00000526080 RAP2BP61225 183 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRU-209ENST00000526080 K7EPK0 472 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 WRBO00258 174 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 PAX4O43316 350 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 SPINK4O60575 86 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 OR5G3P0C626 314 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 SELENOTP62341 195 aa9.28□□□□□ -0.92
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