RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 MAS1LP35410 378 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TALDO1P37837 337 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 SERPINB10P48595 397 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 OR2B8PP59922 312 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DAD1P61803 113 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 GNGT1P63211 74 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 ARFRP1Q13795 201 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 UQCC3Q6UW78 93 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 OR10W1Q8NGF6 305 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC20Q8TCA0 184 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 Q96MT0 163 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 PECRQ9BY49 303 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 MS4A6AQ9H2W1 248 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TREM1Q9NP99 234 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.13□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 FAT1Q14517 4588 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV3A0A0B4J244 114 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 GYG2O15488 501 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 GNG7O60262 68 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 HRASP01112 189 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 IFNA5P01569 189 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 S100A6P06703 90 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LIMS3P0CW19 117 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LIMS4P0CW20 117 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TRAPPC2P0DI81 140 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TRAPPC2BP0DI82 140 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CD37P11049 281 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CD36P16671 472 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 MYL12AP19105 171 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DCKP27707 260 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CCR6P51684 374 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CCL18P55774 89 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CTAG1AP78358 180 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DHRS2Q13268 280 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CLINT1Q14677 625 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 PSG3Q16557 428 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM16LQ309B1 348 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC58Q4VC31 144 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 YIF1BQ5BJH7 314 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 PSMG4Q5JS54 123 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 C22orf42Q6IC83 251 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 OR4S2Q8NH73 311 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 SMIM19Q96E16 107 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 FAM210BQ96KR6 192 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DERL3Q96Q80 235 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 SLC29A1Q99808 456 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 GINS3Q9BRX5 216 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 GABARAPL3Q9BY60 117 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 LPAR5Q9H1C0 372 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 PLGRKTQ9HBL7 147 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 C12orf4Q9NQ89 552 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 BABAM2Q9NXR7 383 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CLEC2DQ9UHP7 191 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 POMPQ9Y244 141 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 AP4S1Q9Y587 144 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 RFNGQ9Y644 331 aa2.12□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV6A0A075B6T7 132 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM189A5PLL7 270 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM14DPA8MWL7 114 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 F5H768 121 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 UPK2O00526 184 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DENRO43583 198 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 ATP5LO75964 103 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CTSGP08311 255 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CHTF8P0CG12 524 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB130BP0DP73 79 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB130AP0DP74 79 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 CELP19835 753 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 NPPCP23582 126 aa2.11□□□□□ -2.07
CLVS1-209ENST00000522928 HTR2BP41595 481 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms