RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 PSG8Q9UQ74 426 aa6.72□□□□□ -1.33
ACTB-208ENST00000464611 RELNP78509 3460 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A6NNC1 897 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SIAH2O43255 324 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-48P01763 117 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DRB1P01911 266 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 C3orf79P0CE67 100 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LYNX1P0DP58 116 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 UBE2E1P51965 193 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 GNG5P63218 68 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SLC35B1P78383 322 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HES1Q14469 280 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 NIT1Q86X76 327 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GUS0 222 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GV90 55 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TCAPO15273 167 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IGLV2-11P01706 119 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IL4P05112 153 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LINC00614P0C842 121 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 CTRLP40313 264 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 CAMPP49913 170 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 EFNA4P52798 201 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 GAGE1Q13065 139 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PET117Q6UWS5 81 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PRNTQ86SH4 94 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RABAC1Q9UI14 185 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.7□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RBAKDNA6NC62 111 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TMEM11P17152 192 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 NTF3P20783 257 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LINC01559Q495D7 138 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SPATA45Q537H7 98 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 Q56UQ5 140 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 Q8N976 141 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 GTSF1Q8WW33 167 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RCHY1Q96PM5 261 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SIRPDQ9H106 197 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A0A087X0K7 114 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TMEM189A5PLL7 270 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 F2Z2F3 143 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TOX4O94842 621 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LEPROTL1O95214 131 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IGLC3P0DOY3 106 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 CDKN1AP38936 164 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TCF24Q7RTU0 167 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ST20Q9HBF5 79 aa6.68□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 C2orf70A6NJV1 201 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 BRI3O95415 125 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PPBPP02775 128 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LEMD1Q68G75 181 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 DPF1Q92782 380 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
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