RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR6V1Q8N148 313 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CT55Q8WUE5 264 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-0.76□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 USE1Q9NZ43 259 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RTL1A6NKG5 1358 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-0.76□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A1W2PRS3 328 aa-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 A6NJ64 397 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM236CP0DP71 79 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 AP1S3Q96PC3 154 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF122Q9H9V4 155 aa-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 CST8O60676 142 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEXIO95424 95 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGLV1-51P01701 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV3-33P01772 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 C8GP07360 202 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SULT1A1P50225 295 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 AESQ08117 197 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q6Q795 121 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR4K15Q8NH41 348 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPCDR1Q9BY65 106 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2F1Q13607 317 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 ESPL1Q14674 2120 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 A6NN06 94 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 HLA-EP13747 358 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 NCAPD3P42695 1498 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 MED13LQ71F56 2210 aa-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 LYRM1O43325 122 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 TGOLN2O43493 480 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SNCBQ16143 134 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM151BQ6UXP7 276 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDI1Q8WTU0 396 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARL5BQ96KC2 179 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 CST11Q9H112 138 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.81□□□□□ -2.54
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