RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 A0A096LNJ9 63 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01546A6NGU7 62 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IGLL5B9A064 214 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM262E9PQX1 116 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FNDC10F2Z333 226 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 F5H5K5 113 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC179H3BU77 68 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SLC31A1O15431 190 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 PDCD6O75340 191 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MPDU1O75352 247 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CEACAM4O75871 244 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 P04436 131 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 ASIPP42127 132 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FXYD2P54710 66 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FUT7Q11130 342 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PSG5Q15238 335 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PLPP4Q5VZY2 271 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 GAPTQ8N292 157 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TET1Q8NFU7 2136 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 NAT6Q93015 286 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FAM131CQ96AQ9 280 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 PRELID3AQ96N28 172 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 SPACA5Q96QH8 159 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TIMM29Q9BSF4 260 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 TPPP3Q9BW30 176 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 NGBQ9NPG2 151 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 TNFSF11O14788 317 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DHRS3O75911 302 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MOSP00540 346 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 C8orf88P0DMB2 117 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF823P16415 610 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 GCHFRP30047 84 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CD70P32970 193 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 UBE2D2P62837 147 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 TFF3Q07654 80 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 CATR1Q13166 79 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRC-202ENST00000367364 NUS1Q96E22 293 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 FER1L5A0AVI2 2057 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-202ENST00000367364 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
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