RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 WT1-ASQ06250 92 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 DPM2O94777 84 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 PYY3Q5JQD4 70 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A16P16260 332 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.67■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 ATP6V0E1O15342 81 aa16.67■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 VCX2Q9H322 139 aa16.66■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 PFN1P07737 140 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 CYYR1Q96J86 154 aa16.65■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 LINC00477Q96M19 166 aa16.65■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.65■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 H3BRM9 83 aa16.64■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa16.64■□□□□ 0.26
NISCH-201ENST00000345716 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.64■□□□□ 0.26
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NISCH-201ENST00000345716 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 SLC25A2Q9BXI2 301 aa16.64■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 C10orf91Q5T1B1 145 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 DKK4Q9UBT3 224 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.63■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 APOMO95445 188 aa16.63■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 OBSL1O75147 1896 aa16.63■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 OVOL3O00110 214 aa16.62■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 C3orf79P0CE67 100 aa16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 GGTLC3B5MD39 225 aa16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.61■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 IGHV1-69P01742 117 aa16.61■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 FXYD7P58549 80 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 C1orf194Q5T5A4 169 aa16.61■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 SHISA9B4DS77 424 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 TOMM7Q9P0U1 55 aa16.6■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 AMN1Q8IY45 258 aa16.6■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 SPCS1Q9Y6A9 102 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 TRBV19A0A075B6N1 114 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 OR13C6PQ8NH95 151 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-201ENST00000345716 HTN3P15516 51 aa16.59■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF492Q9P255 531 aa16.58■□□□□ 0.25
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NISCH-201ENST00000345716 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 MS4A6AQ9H2W1 248 aa16.58■□□□□ 0.24
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NISCH-201ENST00000345716 TMEM75Q8N9X5 138 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 TMEM8BA6NDV4 472 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 SMKR1H3BMG3 65 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 SAP30O75446 220 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 LHBP01229 141 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 CD28P10747 220 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 RNF182Q8N6D2 247 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 GATA3P23771 443 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 ZNF114Q8NC26 417 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 C5orf30Q96GV9 206 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 SMPXQ9UHP9 88 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-201ENST00000345716 RCHY1Q96PM5 261 aa16.56■□□□□ 0.24
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