RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 RS1O15537 224 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 ELK1P19419 428 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP4P55087 323 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 HAMPP81172 84 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 ASAH1Q13510 395 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC190Q86UF4 302 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF182Q8N6D2 247 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 LRTM2Q8N967 370 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TERB2Q8NHR7 220 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JRQ6 117 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYGDP07320 174 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL2P19875 107 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SRIP30626 198 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LEPP41159 167 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CCR6P51684 374 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N814 137 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IL22RA2Q969J5 263 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA60Q9H7X0 242 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT9Q9Y231 359 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MED6O75586 246 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 APOA1P02647 267 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA3P12429 323 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL3P19876 107 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SRPXP78539 464 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR1C1Q04828 323 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SMCO1Q147U7 214 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE4AQ5TA78 99 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 LCN15Q6UWW0 184 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZTI0 123 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TM2D2Q9BX73 214 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087X0K7 114 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 HYPMO75409 117 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ORM1P02763 201 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IL5P05113 134 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R19P59542 299 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MEF2DQ14814 521 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP8Q8NA92 274 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RBKSQ9H477 322 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0B4J2A0 478 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 DISC1C4P0D8 188 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB3DO95716 219 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5G3P0C626 314 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOTP62341 195 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF415Q09FC8 603 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ODF3Q96PU9 254 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9H521 79 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM25AB3EWG3 89 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM25CB3EWG5 89 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM25GB3EWG6 89 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 C9JCJ5 164 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BRN7 92 aa5.29□□□□□ -1.56
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