RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD7P58549 80 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 DTX1Q86Y01 620 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00479Q96M42 142 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF562Q6V9R5 426 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PLXNA3P51805 1871 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 COL8A2P25067 703 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PAX9P55771 341 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2V1Q13404 147 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 BRD3OSQ6XYD6 125 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 CD5LO43866 347 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 GATA4P43694 442 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM7Q96QT4 1865 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf44Q8N8P7 122 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 LIME1Q9H400 295 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 VWA8A3KMH1 1905 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WX48 190 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf36Q3SXR2 165 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM75Q8N9X5 138 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf144Q9BQM9 153 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PKDREJQ9NTG1 2253 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB8O95169 186 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 CKS1BP61024 79 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 IGFL4Q6B9Z1 124 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE2BQ13066 116 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE2EQ4V326 116 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 Q8TCH9 128 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE2DQ9UEU5 116 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ARMS2P0C7Q2 107 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 KIR3DS1Q14943 382 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 S100A7L2Q5SY68 101 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 FER1L5A0AVI2 2057 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 SAP30O75446 220 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 GPR179Q6PRD1 2367 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 E7EQL1 145 aa17.07■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 SMKR1H3BMG3 65 aa17.07■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf32Q8TCD1 76 aa17.07■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF6BO95407 300 aa17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 SAA4P35542 130 aa17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 NBASA2RRP1 2371 aa17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 A8MWP6 167 aa17.06■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 INSP01308 110 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 TDGF1P3P51864 188 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 JPT2Q9H910 190 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CADP27708 2225 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CHAC1Q9BUX1 264 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 PAX4O43316 350 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOKQ9Y6D0 94 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CREBBPQ92793 2442 aa17.05■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 LY6G5BQ8NDX9 201 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1HO95180 2353 aa17.04■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf91Q5T1B1 145 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND6Q6FIF0 208 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 PROK2Q9HC23 129 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1BQ00975 2339 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-39P01597 117 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-39P04432 117 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 FAM231DQ6ZW35 169 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS46E5RG02 174 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 BPESC1Q9GZL8 116 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A16P16260 332 aa17.03■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 OVOL3O00110 214 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 ERCC8Q13216 396 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV19A0A075B6N1 114 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 ESDP10768 282 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZR03 302 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 VGLL1Q99990 258 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM21Q9BVV7 248 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2E1P51965 193 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 FAM104BQ5XKR9 115 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf82Q6UX34 121 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CST9LQ9H4G1 147 aa17.02■□□□□ 0.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF726P1Q15940 193 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 GATD1Q8NB37 220 aa17.02■□□□□ 0.31
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf159Q96HA4 380 aa17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms