RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RHOGP84095 191 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 HSD52Q0P140 79 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 Q5PR19 223 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PRSS33Q8NF86 280 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 RITA1Q96K30 269 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PCSK5Q92824 1860 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CD5LO43866 347 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FABP2P12104 132 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 EFNA4P52798 201 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 KLRD1Q13241 179 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGLL1P15814 213 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 RAB37Q96AX2 223 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LEPP41159 167 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MLST8Q9BVC4 326 aa7.01□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 K7EIM0 57 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SMIM13P0DJ93 91 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ERASQ7Z444 233 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 hDV102S1A0JD36 115 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 OVOL1O14753 267 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 UBE2E1P51965 193 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 EBLN2Q6P2I7 272 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CEP350Q5VT06 3117 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FAM223BA6NKX1 122 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA3O95167 84 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FAM223AQ8IWN6 122 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 RBAKDNA6NC62 111 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LINC01549A6NIU2 74 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TRGV3P03979 118 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 C15orf32Q32M92 178 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PRR25Q96S07 402 aa7□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-17P01599 117 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CD24P25063 80 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ASIPP42127 132 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 USF3Q68DE3 2245 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JLM5 398 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ZNF138P52744 262 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 GTSF1Q8WW33 167 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 C8orf49Q96NF6 230 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 DYSFO75923 2080 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 H3BVH4 76 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TDRG1Q3Y452 100 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 DPM2O94777 84 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MGPP08493 103 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 COX8AP10176 69 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 MPV17L2Q567V2 206 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 M0R3E3 92 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SYT8Q8NBV8 401 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 A6NJY4 79 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CGB1A6NKQ9 187 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SIVA1O15304 175 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ABCA1O95477 2261 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 C7orf71A4D174 169 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGKCP01834 107 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 AMN1Q8IY45 258 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 FOXC2Q99958 501 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 CTRLP40313 264 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 STPG4Q8N801 248 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 LINC00477Q96M19 166 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-201ENST00000264345 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.97□□□□□ -1.29
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