RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 NPBQ8NG41 125 aa8.16□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 LAMA1P25391 3075 aa8.16□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 FCN3O75636 299 aa8.16□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 PSG3Q16557 428 aa8.16□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 ASIPP42127 132 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF56Q15929 161 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 A0A087X0M5 115 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1B0GX30 115 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 TSPOP30536 169 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 SYT8Q8NBV8 401 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.15□□□□□ -1.1
TTPAL-201ENST00000262605 CBY3A6NI87 242 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 P0C879 139 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 DUX3Q96PT4 197 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ABCA1O95477 2261 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 DSCAMO60469 2012 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TEX22C9J3V5 150 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 COL6A3P12111 3177 aa8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 SH2D1AO60880 128 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LMO4P61968 165 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PMCHL1Q16048 86 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N9W7 124 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 FXYD5Q96DB9 178 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 H3BRN7 92 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 CD7P09564 240 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TSKUQ8WUA8 353 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 J3QLI3 93 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 Q86TA4 180 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 I3L2K1 104 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 HLA-DMBP28068 263 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PRELID3AQ96N28 172 aa8.14□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 SAP30O75446 220 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 SERF1AO75920 110 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZN92 141 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01587Q99440 93 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 NUP35Q8NFH5 326 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 K7EIM0 57 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 NUDT3O95989 172 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 EVI2AP22794 236 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 EMP1P54849 157 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 H3BVH4 76 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LEPROTL1O95214 131 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 RRN3P1Q2M238 152 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 C18orf15Q96N68 181 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PAX1P15863 534 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB136Q30KP8 78 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PATE2Q6UY27 113 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.12□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01548A6NM66 108 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 STHQ8IWL8 128 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 USP34Q70CQ2 3546 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PPR1 153 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 JMJD8Q96S16 334 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 42
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 HOXA5P20719 270 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 ODF3BA8MYP8 253 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TCAPO15273 167 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 KCNS1Q96KK3 526 aa8.11□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 OVOL1O14753 267 aa8.1□□□□□ -1.11
TTPAL-201ENST00000262605 FOXL1Q12952 345 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms