RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	NDP	Q00604	133 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	BAX	Q07812	192 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	UTF1	Q5T230	341 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		Q8IYB0	196 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PRR18	Q8N4B5	295 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	LFNG	Q8NES3	379 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RAB40C	Q96S21	281 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RBKS	Q9H477	322 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	BIN3	Q9NQY0	253 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	DKK2	Q9UBU2	259 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ODAM	A1E959	279 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	C5orf52	A6NGY3	159 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00473	A8K010	186 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		H3BQ15	152 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	C15orf65	H3BRN8	121 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PROP1	O75360	226 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	MT-ND4L	P03901	98 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CXCL1	P09341	107 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RAB5A	P20339	215 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	G6PC	P35575	357 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	AKR1D1	P51857	326 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	EDDM3B	P56851	147 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	AES	Q08117	197 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF266	Q14584	549 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RHEB	Q15382	184 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IFITM10	A6NMD0	228 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		H0YJW9	148 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		J3QR06	171 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RAB29	O14966	203 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	DFFB	O76075	338 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR2C1	O95371	312 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	HBE1	P02100	147 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CGB3	P0DN86	165 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CGB7	P0DN87	165 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	BCL2	P10415	239 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	S100G	P29377	79 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SSTR5	P35346	364 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	MEOX2	P50222	304 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CEBPG	P53567	150 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RAB2A	P61019	212 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RAB5B	P61020	215 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2K	P61086	200 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		Q3ZCU0	254 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SPINK9	Q5DT21	86 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	LCN15	Q6UWW0	184 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	STX12	Q86Y82	276 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		Q8N3U1	123 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR5B3	Q8NH48	314 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		Q8WTZ3	238 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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