RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	MSMB	P08118	114 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HSBP1	O75506	76 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TOX4	O94842	621 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	UBE2G1	P62253	170 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ACAN	P16112	2415 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF137P	P52743	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1W2PRD5	423 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1W2PRF3	423 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1W2PRM7	423 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TAS2R45	P59539	299 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	PAX8	Q06710	450 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997		B4DSR2	109 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	UPK2	O00526	184 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	IGLL1	P15814	213 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	CRYBB3	P26998	211 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TNC	P24821	2201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	APOA2	P02652	100 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	NTF3	P20783	257 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997		M0R2Z0	102 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	MYOD1	P15172	320 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	PSG5	Q15238	335 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	VAMP3	Q15836	100 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TNXA	Q16473	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	SLA	Q13239	276 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	CST9L	Q9H4G1	147 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HTR1D	P28221	377 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	FOXC2	Q99958	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BRF1-208	ENST00000546997	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	TAX1BP3	O14907	124 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	SPINK4	O60575	86 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	UBE2E1	P51965	193 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	FXYD3	Q14802	87 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BRF1-208	ENST00000546997	RPE	Q96AT9	228 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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