RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAMB2P55268 1798 aa5.42□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C4BP0C0L5 1744 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.41□□□□□ -1.54
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATOX1O00244 68 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLA-DQA1P01909 254 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLA2G5P39877 138 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MORN4Q8NDC4 146 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DSCR8Q96T75 97 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TIMM17AQ99595 171 aa5.41□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL4A3Q01955 1670 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCL1BO95988 128 aa5.4□□□□□ -1.54
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADIGQ0VDE8 80 aa5.4□□□□□ -1.54
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00596Q86U02 117 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C3orf56Q8N813 242 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF747Q9BV97 191 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.4□□□□□ -1.54
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.4□□□□□ -1.55
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.39□□□□□ -1.55
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.39□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.39□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.39□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.39□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.39□□□□□ -1.55
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL4A1P02462 1669 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COX7A2P2O60397 106 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SOD1P00441 154 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSRP3P50461 194 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ERVK-16P61578 105 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TFF2Q03403 129 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GFRALQ6UXV0 394 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GTSF1Q8WW33 167 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGST2Q99735 147 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAMA4Q16363 1823 aa5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LY75O60449 1722 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCN2AQ99250 2005 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NXPH4O95158 308 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HBDP02042 147 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CD7P09564 240 aa5.37□□□□□ -1.55
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MPV17P39210 176 aa5.37□□□□□ -1.55
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