RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 SDC2P34741 201 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 SSR2P43308 183 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 PSG9Q00887 426 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 LINC00471Q8N535 108 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CST9LQ9H4G1 147 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 UBL3O95164 117 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 HMGN1P05114 100 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 GPX2P18283 190 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 SDC4P31431 198 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CKS1BP61024 79 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 LZICQ8WZA0 190 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 LXNQ9BS40 222 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 ROMO1P60602 79 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CCDC153Q494R4 210 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TEX29Q8N6K0 151 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 BORCS5Q969J3 196 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TMEM189A5PLL7 270 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 J3QRE1 110 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 OR1I1O60431 355 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TNFSF15O95150 251 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 IGLV1-51P01701 117 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 IFNA4P05014 189 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 AKR1C3P42330 323 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 NDUFA6P56556 154 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 PSPHP78330 225 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 ELOBQ15370 118 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 VMA21Q3ZAQ7 101 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 Q5XG85 94 aa2.28□□□□□ -2.04
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HERC3-209ENST00000504994 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 TMEM138Q9NPI0 162 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 NIT2Q9NQR4 276 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 SPANXCQ9NY87 97 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 GBF1Q92538 1859 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 STRCP1A6NGW2 1772 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-209ENST00000504994 DISP1Q96F81 1524 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 NCAPD3P42695 1498 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
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HERC3-209ENST00000504994 CPDO75976 1380 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa2.27□□□□□ -2.05
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HERC3-209ENST00000504994 C9JAW5 83 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 CMPK1P30085 196 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 KLRD1Q13241 179 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 C4orf22Q6V702 233 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 FAM107BQ9H098 131 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 RP1P56715 2156 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 PIK3C2AO00443 1686 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 C2orf70A6NJV1 201 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 H3BMG7 143 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 PROSCO94903 275 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 MT-ND6P03923 174 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.26□□□□□ -2.05
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HERC3-209ENST00000504994 RTL9Q8NET4 1388 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 M0QZK8 103 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 SCTP09683 121 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 DEFB115Q30KQ5 88 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 Q8N814 137 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 OR5H6Q8NGV6 325 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 BRK1Q8WUW1 75 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 Q96M85 177 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 A2MP01023 1474 aa2.25□□□□□ -2.05
HERC3-209ENST00000504994 COL4A5P29400 1685 aa2.25□□□□□ -2.05
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