RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 PROSCO94903 275 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFAIP8O95379 198 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSTAP01040 98 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 HAMPP81172 84 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAV1Q03135 178 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf194Q5T5A4 169 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4E2Q8NGC2 313 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5B17Q8NGF7 314 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAT14Q8WUY8 206 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 DERL1Q9BUN8 251 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM147Q9BVK8 224 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIPINQ9BVW5 301 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 CXorf21Q9HAI6 301 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 POFUT2Q9Y2G5 429 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBR2Q8IWV8 1755 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.84□□□□□ -2.54
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERVK-7P63135 1459 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYNMO15061 1565 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LY75O60449 1722 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CALRP27797 417 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFITM2Q01629 132 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 STX3Q13277 289 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLAMF1Q13291 335 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LYG2Q86SG7 212 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 FANCMQ8IYD8 2048 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T4Q8NH00 348 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CANT1Q8WVQ1 401 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLAC4Q8WY50 150 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED10Q9BTT4 135 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP98P52948 1817 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.85□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLXNA2O75051 1894 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERBINQ96RT1 1412 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGKV1-5P01602 117 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNNC1P63316 161 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 XIAPP98170 497 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO48Q5FWF7 155 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 AADACL3Q5VUY0 350 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNM1P34Q6PK57 102 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLECL1Q8IZS7 167 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PXT1Q8NFP0 134 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR13C4Q8NGS5 318 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEX47Q8TBZ9 253 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC20Q8TCA0 184 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00052Q96N35 136 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MS4A6AQ9H2W1 248 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOP2BQ02880 1626 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTPRMP28827 1452 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABCA3Q99758 1704 aa-0.86□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOCK4Q8N1I0 1966 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYO3BQ8WXR4 1341 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF879B4DU55 563 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB4AO15263 64 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TFF1P04155 84 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNE1P15382 129 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP3K7CLP57077 242 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB1P60022 68 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDKL4Q5MAI5 379 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIR17HGQ75NE6 70 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MSANTD3Q96H12 275 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HDHD2Q9H0R4 259 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf109Q9NX04 203 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ORMDL1Q9P0S3 153 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRC1P22897 1456 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOA2Q15596 1464 aa-0.87□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DOCK1Q14185 1865 aa-0.88□□□□□ -2.55
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