RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	ASAH1	Q13510	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	BAK1	Q16611	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	DOK5	Q9P104	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A096LPF7	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RGS5	O15539	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PSCA	O43653	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ADAP1	O75689	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GNAO1	P09471	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ELK1	P19419	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	S100P	P25815	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10J1	P30954	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MEOX2	P50222	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RND2	P52198	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	FABP5	Q01469	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAM1	Q15629	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	C12orf57	Q99622	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		U3KQ87	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		H3BNG1	76 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SOCS3	O14543	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MYL9	P24844	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TAS2R60	P59551	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		Q5BKY6	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	GPR31	O00270	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ISLR	O14498	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RLN2	P04090	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PSG1	P11464	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB3B	P20337	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RHOB	P62745	196 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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