RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444609.1

HDAC8-215, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC8, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-215ENST00000444609 NAT1P18440 290 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RANBP1P43487 201 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 OR10A3P58181 314 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TIRAPP58753 221 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 BSXQ3C1V8 233 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 REG3GQ6UW15 175 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RNF182Q8N6D2 247 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 NPIPB3Q92617 1050 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM80Q96HE8 168 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RSG1Q9BU20 258 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SPINK4O60575 86 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 GABARAPL2P60520 117 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF846Q147U1 533 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 C4orf46Q504U0 113 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM17Q86X19 198 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SLC35G3Q8N808 338 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 BORCS5Q969J3 196 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 VAX2Q9UIW0 290 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 COX11Q9Y6N1 276 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SSX5O60225 188 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ORM1P02763 201 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 GNAO1P09471 354 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RAB6AP20340 208 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 GALR1P47211 349 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IDNKQ5T6J7 187 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF738Q8NE65 137 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1-39P01597 117 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1D-39P04432 117 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 FGL1Q08830 312 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 VGLL1Q99990 258 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.41□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 HTR2BP41595 481 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 TMBIM6P55061 237 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 BEST4Q8NFU0 473 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ACY3Q96HD9 319 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 V9GY05 133 aa6.4□□□□□ -1.38
HDAC8-215ENST00000444609 MUC17Q685J3 4493 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PHOX2AO14813 284 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CBX5P45973 191 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PPT1P50897 306 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 GNG2P59768 71 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ENY2Q9NPA8 101 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 HERV-K104P61576 105 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 LYZP61626 148 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PRR4Q16378 134 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SCN3BQ9NY72 215 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TCL1AP56279 114 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF90Q03938 601 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 C2orf83Q53S99 150 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TOR2AQ5JU69 321 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms