RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 LCTP09848 1927 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 TMEM213A2RRL7 107 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 GAGE12JA6NER3 117 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 WIPF3A6NGB9 483 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 GAGE7O76087 117 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 GAGE12FP0CL80 117 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 GAGE12GP0CL81 117 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 GAGE12IP0CL82 117 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 GAGE4Q13068 117 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 Q86TA4 180 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.02□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.01□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 GAGE6Q13070 117 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 METRNQ9UJH8 293 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 H3BMM0 161 aa8.01□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 Q6P435 159 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 C1orf210Q8IVY1 113 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 IMMP1LQ96LU5 166 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 IL18BPO95998 194 aa8□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 DUX5Q96PT3 197 aa8□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 SAP25Q8TEE9 199 aa7.99□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.99□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-39P04432 117 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 SLC25A16P16260 332 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 DUX3Q96PT4 197 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.98□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF492Q9P255 531 aa7.98□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.97□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 CT83Q5H943 113 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 VWCEQ96DN2 955 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 ANK1P16157 1881 aa7.97□□□□□ -1.13
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HERC3-202ENST00000402738 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-11P01762 117 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 PMVKQ15126 192 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-202ENST00000402738 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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