RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	PHO86	P46956	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	DAS1	P47005	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HUL5	P53119	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SIW14	P53965	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	STE23	Q06010	1027 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SDH5	Q08230	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RAD10	P06838	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RRT12	P25381	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SWI3	P32591	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CSG2	P35206	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YKR018C	P36114	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	VID24	P38263	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	NET1	P47035	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SGM1	P47166	707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YGR111W	P53265	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	JJJ1	P53863	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	USA1	Q03714	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	UFO1	Q04511	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	REC8	Q12188	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ECM3	Q99252	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	BI2	P03873	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	BI4	P03879	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	BAS1	P22035	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CLB1	P24868	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	GYP6	P32806	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TFC4	P33339	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	MSG5	P38590	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	MMS21	P38632	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TAT2	P38967	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PUS2	P53167	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TYW3	P53177	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CUL3	P53202	744 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	HXT15	P54854	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	DBF4	P32325	704 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TMT1	P32643	299 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	GIP2	P40036	548 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	ASG7	P46993	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	URB2	P47108	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	PIG1	Q06216	648 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	SHS1	Q07657	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YIG1	Q08956	461 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTC5	YOR118W	COX4	P04037	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	CBF1	P17106	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	PLC1	P32383	869 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	OAF3	P36023	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SAP185	P40856	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	RNH70	P53331	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	RPN4	Q03465	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	SPO20	Q04359	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTC5	YOR118W	TAF9	Q05027	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.1 ms