RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	TOP1	P04786	769 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	HMG2	P12684	1045 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	ATP12	P22135	325 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	DAL3	P32459	195 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	HXT4	P32467	576 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YPT10	P38146	199 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	USA1	Q03714	838 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	SAP4	P53036	818 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
CIK1	YMR198W	RGT2	Q12300	763 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YFL015C	P43578	164 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	SEC5	P89102	971 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	AIM41	Q12032	185 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	WHI2	P12611	486 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YGR237C	P50089	785 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
CIK1	YMR198W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	EXO1	P39875	702 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	BST1	P43571	1029 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	PCL8	Q08966	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	ATP23	P53722	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	CIR2	Q08822	631 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	VPS33	P20795	691 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	STP1	Q00947	519 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	GEP3	Q08622	556 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIK1	YMR198W	BEM3	P32873	1128 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	RPC34	P32910	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	LOT5	P34234	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	CCL1	P37366	393 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YJL193W	P39542	402 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YJL043W	P47053	257 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	PEF1	P53238	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	GSY2	P27472	705 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	DGR2	P32330	852 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	BRN1	P38170	754 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	TDA10	P42938	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	IRC5	P43610	853 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	NMD5	P46970	1048 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	TGS1	Q12052	315 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	RSC9	Q03124	581 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	MPS1	P54199	764 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	ORM2	Q06144	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YNL092W	P53934	400 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	WAR1	Q03631	944 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	IRC3	Q06683	689 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	PCK1	P10963	549 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YEL076C	P39971	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	SKY1	Q03656	742 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	BSP1	Q06604	576 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	DSS4	P32601	143 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	SAE2	P46946	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	MRPL9	P31334	269 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	APD1	P38281	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	NIT2	P47016	307 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	MNT2	P53059	558 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	RMP1	Q12530	201 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CIK1	YMR198W	AAC1	P04710	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	ARG1	P22768	420 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	EAF5	P39995	279 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	CWH43	P25618	953 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	EUG1	P32474	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CIK1	YMR198W	CDC5	P32562	705 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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