RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TINF2	Q9BSI4	451 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	USP26	Q9BXU7	913 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GJA8	P48165	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GRIK4	Q16099	956 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175		Q6ZS46	218 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC3	Q9BY71	257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CBX8	Q9HC52	389 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	STK17A	Q9UEE5	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	FAM221A	A4D161	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SEPT6	Q14141	434 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ACAD11	Q709F0	780 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	KCNB2	Q92953	911 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SPON2	Q9BUD6	331 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	WDR18	Q9BV38	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CILP	O75339	1184 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	F13A1	P00488	732 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TNNI2	P48788	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PAK2	Q13177	524 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ADGRE1	Q14246	886 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	PDE3A	Q14432	1141 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	NACC1	Q96RE7	527 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	C9orf172	C9J069	976 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	AOC2	O75106	756 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	TIAF1	O95411	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	LIG1	P18858	919 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	CRK	P46108	304 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GSK3A	P49840	483 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	MPP2	Q14168	576 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATRX-223	ENST00000637175	KRBA1	A5PL33	1030 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	GFRA2	O00451	464 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	APBA3	O96018	575 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	LMNB1	P20700	586 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	RING1	Q06587	406 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	MBTPS1	Q14703	1052 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	FBXO27	Q8NI29	283 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	ADH5	P11766	374 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	NOS3	P29474	1203 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	CDK8	P49336	464 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATRX-223	ENST00000637175	KCNMA1	Q12791	1236 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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