RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 HAND2P61296 217 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLF2Q8IX21 1173 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS6KB1P23443 525 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PDRG1Q9NUG6 133 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GAKO14976 1311 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 DACT2Q5SW24 774 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MXD3Q9BW11 206 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L3A6NCW0 530 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L4A6NCW7 530 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BAG3O95817 575 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TDO2P48775 406 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 AK2P54819 239 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF3Q9H094 633 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 YDJCA8MPS7 323 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CERS3Q8IU89 383 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BCS1LQ9Y276 419 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PSME4Q14997 1843 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 COL4A5P29400 1685 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BTDP43251 543 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TMX3Q96JJ7 454 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 F8W031 263 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NFKBIEO00221 500 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-215ENST00000628018 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NCOA7Q8NI08 942 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MRIQ9BWK5 157 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCG2P16885 1265 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PPARAQ07869 468 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD1Q15327 319 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RHBDL3P58872 404 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CTR9Q6PD62 1173 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL4AQ13619 759 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NIM1KQ8IY84 436 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 USP5P45974 858 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SCNN1DP51172 638 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TRDNQ13061 729 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SBK1Q52WX2 424 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TEKT1Q969V4 418 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMB1P07942 1786 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L12C9JPN9 530 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L21D6R901 530 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZUG5 572 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 VIL1P09327 827 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NEDD4P46934 1319 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MCM5P33992 734 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CRKP46108 304 aa29.45■■■□□ 2.3
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