RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590599.1

CTDP1-205, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 1,762 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-205ENST00000590599 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 CEP350Q5VT06 3117 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 E7EWF7 191 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 PRKAB2O43741 272 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 TDO2P48775 406 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 AK2P54819 239 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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CTDP1-205ENST00000590599 SOGA3Q5TF21 947 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 PODNQ7Z5L7 613 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 TMX3Q96JJ7 454 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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CTDP1-205ENST00000590599 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 SLF2Q8IX21 1173 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDP1-205ENST00000590599 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-205ENST00000590599 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.46■■□□□ 1.03
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CTDP1-205ENST00000590599 BAG3O95817 575 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDP1-205ENST00000590599 LMNB1P20700 586 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDP1-205ENST00000590599 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDP1-205ENST00000590599 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDP1-205ENST00000590599 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CTDP1-205ENST00000590599 CERS3Q8IU89 383 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDP1-205ENST00000590599 NCOA7Q8NI08 942 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDP1-205ENST00000590599 NBPF3Q9H094 633 aa21.43■■□□□ 1.02
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CTDP1-205ENST00000590599 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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CTDP1-205ENST00000590599 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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CTDP1-205ENST00000590599 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CTDP1-205ENST00000590599 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDP1-205ENST00000590599 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-205ENST00000590599 COL4A5P29400 1685 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDP1-205ENST00000590599 DACT2Q5SW24 774 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-205ENST00000590599 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-205ENST00000590599 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-205ENST00000590599 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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