RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 IL27Q8NEV9 243 aa23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NBPF3Q9H094 633 aa23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 DACT2Q5SW24 774 aa23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 USP17L3A6NCW0 530 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 USP17L4A6NCW7 530 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 RPS6KB1P23443 525 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 TDO2P48775 406 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 AK2P54819 239 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 PPP4CP60510 307 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 VPS33BQ9H267 617 aa23.42■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 COL4A5P29400 1685 aa23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 BAG3O95817 575 aa23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 MCM2P49736 904 aa23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 BTDP43251 543 aa23.4■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 SLF2Q8IX21 1173 aa23.4■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 GAKO14976 1311 aa23.4■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NFKBIEO00221 500 aa23.39■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.39■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.39■■□□□ 1.34
PGS1-211ENST00000589425 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 SCNN1DP51172 638 aa23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 TMX3Q96JJ7 454 aa23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 INCENPQ9NQS7 918 aa23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 SMIM22K7EJ46 135 aa23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 CTR9Q6PD62 1173 aa23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 UTRNP46939 3433 aa23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 LAMA4Q16363 1823 aa23.36■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 RAD17O75943 681 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 RHBDL3P58872 404 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 PPARAQ07869 468 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 NCOA7Q8NI08 942 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 USP17L12C9JPN9 530 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 USP17L21D6R901 530 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 CHST3Q7LGC8 479 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 CERS3Q8IU89 383 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 NIM1KQ8IY84 436 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.35■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 USP5P45974 858 aa23.34■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 TEKT1Q969V4 418 aa23.34■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.34■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 PSMD14O00487 310 aa23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 Q6ZUG5 572 aa23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 MRIQ9BWK5 157 aa23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.33■■□□□ 1.33
PGS1-211ENST00000589425 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 RASSF7Q02833 373 aa23.33■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 EVX2Q03828 476 aa23.33■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 TEX11Q8IYF3 940 aa23.33■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 NEDD4P46934 1319 aa23.33■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 PLCG2P16885 1265 aa23.32■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 CRKP46108 304 aa23.32■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 TRDNQ13061 729 aa23.32■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PGS1-211ENST00000589425 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.32■■□□□ 1.32
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