RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUL7 405 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TLL1O43897 1013 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE8BO95263 885 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GYG1P46976 350 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SCARF1Q14162 830 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 STYK1Q6J9G0 422 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PI16Q6UXB8 463 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRKQ9NRH2 765 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 JAG2Q9Y219 1238 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 BCS1LQ9Y276 419 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 LTBP1Q14766 1721 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 UFL1O94874 794 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 FGFR2P21802 821 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 OSBPP22059 807 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PHKA1P46020 1223 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SP8Q8IXZ3 490 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL6Q8N841 843 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 XAGE2Q96GT9 111 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM47Q96LD4 638 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 POLLQ9UGP5 575 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf229H3BNL8 230 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 BBOX1O75936 387 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CHGBP05060 677 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 MX1P20591 662 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH1B1P30837 517 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNJ4P48050 445 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE1AP54750 535 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 RASSF7Q02833 373 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PADI6Q6TGC4 694 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 MPNDQ8N594 471 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CNKSR1Q969H4 720 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SYT17Q9BSW7 474 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PIM2Q9P1W9 311 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 COL4A5P29400 1685 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SNED1Q8TER0 1413 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 XDHP47989 1333 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC5A1P13866 664 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PRELPP51888 382 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TGFB2P61812 414 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 GORABQ5T7V8 394 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC22Q5TAA0 569 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 GGA1Q9UJY5 639 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.234e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-208ENST00000589162 ZAP70P43403 619 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 AOC3Q16853 763 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC102BQ68D86 513 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 LPIN2Q92539 896 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 MXD3Q9BW11 206 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR108Q9NPR9 543 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 NFKBIEO00221 500 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLIM4O00461 696 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 SDSP20132 328 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2B4P23634 1241 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 MCAMP43121 646 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 RASGRF1Q13972 1273 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE4AQ14139 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
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