RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587329.1

DNM2-208, Transcript of dynamin 2, human

TSL 3

Gene DNM2, Length 498 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM2-208	ENST00000587329	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	AOX1	Q06278	1338 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	BAG3	O95817	575 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	TNNI2	P48788	182 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	CACNB3	P54284	484 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	LAMB1	P07942	1786 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	PDE6A	P16499	860 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	FSTL1	Q12841	308 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	PICALM	Q13492	652 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	GAK	O14976	1311 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	IGSF3	O75054	1194 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ADD2	P35612	726 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DNM2-208	ENST00000587329	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TRAF5	O00463	557 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PLCG2	P16885	1265 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TCP10	Q12799	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	NF2	P35240	595 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	USP5	P45974	858 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	CHGB	P05060	677 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	RASA3	Q14644	834 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	MBD4	O95243	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PRKG1	Q13976	671 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	APPBP2	Q92624	585 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	NFIA	Q12857	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	RHBDL3	P58872	404 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	PPP4C	P60510	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.59	□□□□□ -0.23
DNM2-208	ENST00000587329	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms