RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 PDE3AQ14432 1141 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 STOML1Q9UBI4 398 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CHD1O14646 1710 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 TM4SF5O14894 197 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ATP11AP98196 1134 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 SLFN5Q08AF3 891 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 OR13H1Q8NG92 308 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 A6NJR5 290 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 PAX4O43316 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 COBLO75128 1261 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 BECN1Q14457 450 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CLTCL1P53675 1640 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ATP7AQ04656 1500 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 TNFRSF10BO14763 440 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 PRMT3O60678 531 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ADAMTS4O75173 837 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 IRAK1P51617 712 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 OCLNQ16625 522 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CDC27P30260 824 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 HYAL2Q12891 473 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CEP135Q66GS9 1140 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 C16orf46Q6P387 395 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CEP41Q9BYV8 373 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 KIF1BO60333 1816 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 NSD2O96028 1365 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 TXKP42681 527 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 NFIAQ12857 509 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRM-212ENST00000580838 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 SPINK2P20155 84 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 UVSSAQ2YD98 709 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ADGRL1O94910 1474 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ERVK-7P63135 1459 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ABCA6Q8N139 1617 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 HMX2A2RU54 273 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 PRR19A6NJB7 356 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 ADAM11O75078 769 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-212ENST00000580838 KIF4AO95239 1232 aa7.34□□□□□ -1.23
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