RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRIK5Q16478 980 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRF1Q92994 677 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 C21orf2O43822 256 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 TDO2P48775 406 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK3Q13188 491 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.08■□□□□ 0.97
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF2IP78347 998 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 DOK7Q18PE1 504 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PODNQ7Z5L7 613 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCOA7Q8NI08 942 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.08■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHD4Q14839 1912 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCM4P33991 863 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC93Q567U6 631 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.07■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 G3V3G9 751 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 LDHCP07864 332 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 APOBRQ0VD83 1088 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 INCENPQ9NQS7 918 aa21.06■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRC1O43663 620 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCM5P33992 734 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRDNQ13061 729 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIM2Q9P1W9 311 aa21.05■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP4CP60510 307 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 GBP4Q96PP9 640 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMD1Q99460 953 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJB2P29033 226 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTGER2P43116 358 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANTXR2P58335 489 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CERS3Q8IU89 383 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLF2Q8IX21 1173 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.04■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 B4E1Z4 1266 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAG3O95817 575 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOGA3Q5TF21 947 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEDD4P46934 1319 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.03■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 ECE2O60344 883 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRD1O95696 1058 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 AOC3Q16853 763 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXL16Q8N461 479 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 CERS5Q8N5B7 392 aa21.02■□□□□ 0.96
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAKO14976 1311 aa21.02■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF3C6Q969F1 213 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXW7Q969H0 707 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPARAQ07869 468 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH2Q9UKX2 1941 aa21■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PFKFB2O60825 505 aa21■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAG1Q8WVM7 1258 aa21■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 VPS33BQ9H267 617 aa21■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPIP5K2O43314 1243 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCRN1Q12765 414 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM22K7EJ46 135 aa20.99■□□□□ 0.95
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYT1P21579 422 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms