RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 WNT10BO00744 389 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL25Q9H293 177 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 RRAGCQ9HB90 399 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 MBD4O95243 580 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPHX2P34913 555 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP4CP60510 307 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARMT1Q9H993 441 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.48■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAG3O95817 575 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 RHBDL3P58872 404 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCORLQ8N3X6 602 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.47■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.46■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 AIDAQ96BJ3 306 aa22.46■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP40Q9NVE5 1235 aa22.46■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPAA1O43292 621 aa22.45■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLRN2A0PK11 232 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CACNB3P54284 484 aa22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 SGSM2O43147 1006 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRKAB2O43741 272 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASC1Q6TDU7 716 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 TEX11Q8IYF3 940 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYO1BO43795 1136 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLCG2P16885 1265 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAD50Q92878 1312 aa22.41■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 POTEIP0CG38 1075 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 POTEJP0CG39 1038 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 YY1P25490 414 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFIAQ12857 509 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 VPS53Q5VIR6 699 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CERS3Q8IU89 383 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 VEZTQ9HBM0 779 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOCADQ5VW36 1801 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 C8orf34Q49A92 452 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 GGA3Q9NZ52 723 aa22.4■■□□□ 1.18
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXP2O15409 715 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 PICALMQ13492 652 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.39■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP5P45974 858 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 IDI2Q9BXS1 227 aa22.38■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNAT2P19087 354 aa22.37■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 FLT1P17948 1338 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTH1RQ03431 593 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCP10Q12799 353 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.36■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNTNAP1P78357 1384 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 APPP05067 770 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms