RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LINS1Q8NG48 757 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ATG3Q9NT62 314 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN2P17655 700 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ATP2B4P23634 1241 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA4P34932 840 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CSADQ9Y600 493 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 USP19O94966 1318 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 EBAG9O00559 213 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 STIM1Q13586 685 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 IWS1Q96ST2 819 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SPC25Q9HBM1 224 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PDE8AO60658 829 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPFIA2O75334 1257 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SCP2P22307 547 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DPF3Q92784 378 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 INSRP06213 1382 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DIP2BQ9P265 1576 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC93Q567U6 631 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 HHATQ5VTY9 493 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ATL2Q8NHH9 583 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TTC14Q96N46 770 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA9P43362 315 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ATP2B3Q16720 1220 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC102AQ96A19 550 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2R1Q13018 1463 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP5P59047 1200 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DAAM2Q86T65 1068 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 H0YC42 278 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ILDR2Q71H61 639 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TEX11Q8IYF3 940 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DCCP43146 1447 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 KINO60870 393 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 BRD1O95696 1058 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 FERP16591 822 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PAX7P23759 505 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PP64 1363 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 BECN2A8MW95 431 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 POTEB2H3BUK9 544 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPIP5K2O43314 1243 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 TUBB4AP04350 444 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 E2F4Q16254 413 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 EYA1Q99502 592 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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