RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 LMAN1P49257 510 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRB-208ENST00000550358 NCAPD2Q15021 1401 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-208ENST00000550358 A6NNZ2 444 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRB-208ENST00000550358 GNG11P61952 73 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-208ENST00000550358 SPATA5Q8NB90 893 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA1Q92805 767 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-208ENST00000550358 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-208ENST00000550358 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRB-208ENST00000550358 MYL5Q02045 173 aa9.55□□□□□ -0.88
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