RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 FSD1Q9BTV5 496 aa21.65■■□□□ 1.06
BRF1-209ENST00000547052 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.65■■□□□ 1.06
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BRF1-209ENST00000547052 CLRN2A0PK11 232 aa21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 BTDP43251 543 aa21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 HOOK2Q96ED9 719 aa21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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BRF1-209ENST00000547052 EVI5LQ96CN4 794 aa21.63■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.63■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 USP40Q9NVE5 1235 aa21.63■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.62■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 USP48Q86UV5 1035 aa21.62■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.62■■□□□ 1.05
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BRF1-209ENST00000547052 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.62■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 PDE6AP16499 860 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 C1QTNF8P60827 252 aa21.61■■□□□ 1.05
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BRF1-209ENST00000547052 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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BRF1-209ENST00000547052 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 TICAM2Q86XR7 235 aa21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 RILPL2Q969X0 211 aa21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 UBE3CQ15386 1083 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 FAM83AQ86UY5 434 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 TEX11Q8IYF3 940 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.58■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ADM5C9JUS6 153 aa21.58■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 ADD2P35612 726 aa21.58■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 AIDAQ96BJ3 306 aa21.58■■□□□ 1.05
BRF1-209ENST00000547052 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.58■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 HIP1O00291 1037 aa21.57■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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BRF1-209ENST00000547052 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 USP5P45974 858 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 APLP1P51693 650 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 PPP4CP60510 307 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 RASA3Q14644 834 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 CDCA5Q96FF9 252 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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BRF1-209ENST00000547052 ENTPD3O75355 529 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 PICALMQ13492 652 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 APPBP2Q92624 585 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 PASKQ96RG2 1323 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 TRAF5O00463 557 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 CACNB3P54284 484 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 TTC22Q5TAA0 569 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 DCAF15Q66K64 600 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 FAM151AQ8WW52 585 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 IDI2Q9BXS1 227 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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BRF1-209ENST00000547052 FKBP1BP68106 108 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 TCP10Q12799 353 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 ZNF384Q8TF68 577 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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BRF1-209ENST00000547052 PDE4AP27815 886 aa21.52■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
BRF1-209ENST00000547052 LAMB1P07942 1786 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 MBD4O95243 580 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 HLA-DOAP06340 250 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.51■■□□□ 1.03
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