RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 CORO1BQ9BR76 489 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 PIM2Q9P1W9 311 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ECEL1O95672 775 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 B3GALT4O96024 378 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 RAB6AP20340 208 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 DYMQ7RTS9 669 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 SHISA5Q8N114 240 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ZNF576Q9H609 170 aa8.37□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 UNCXA6NJT0 531 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 WNT11O96014 354 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ITPKAP23677 461 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ADMP35318 185 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 PDE3AQ14432 1141 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 NFICP08651 508 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ABCB6Q9NP58 842 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 RNF19AQ9NV58 838 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 PARP2Q9UGN5 583 aa8.34□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 PI16Q6UXB8 463 aa8.33□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FOSL1P15407 271 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 GNA15P30679 374 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 ASPAP45381 313 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 DAB2P98082 770 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 MAP7Q14244 749 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 TMC4Q7Z404 712 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 ZAR1Q86SH2 424 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FRMD6Q96NE9 622 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FAM170BA6NMN3 283 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 CYP26A1O43174 497 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 AOC2O75106 756 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 AP3B2Q13367 1082 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 GRM2Q14416 872 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 LGR6Q9HBX8 967 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.31□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 PAX4O43316 350 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FAM161BQ96MY7 647 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 WDR18Q9BV38 432 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 SPG7Q9UQ90 795 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.3□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 GIPC1O14908 333 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 VAMP1P23763 118 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FAAP100Q0VG06 881 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 PSMD2Q13200 908 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 MSMPQ1L6U9 139 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 AK5Q9Y6K8 562 aa8.29□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 LIG1P18858 919 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 FCGRTP55899 365 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 GATA6Q92908 595 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 BCO2Q9BYV7 579 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 BCL11AQ9H165 835 aa8.28□□□□□ -1.08
TRDN-204ENST00000542443 E9PSI1 815 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 SORBS3O60504 671 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 C12orf49Q9H741 205 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.27□□□□□ -1.09
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