RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	RGS3	P49796	1198 aa		11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.27	□□□□□ -0.6
MLH1-222	ENST00000539477	MYH8	P13535	1937 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PDE6A	P16499	860 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CYP7A1	P22680	504 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	EVX2	Q03828	476 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	GAK	O14976	1311 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MAST3	O60307	1309 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.27	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MYO1B	O43795	1136 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	RASA3	Q14644	834 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CST9	Q5W186	159 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	RHBDL3	P58872	404 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	GRM1	Q13255	1194 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	FAM196B	A6NMK8	535 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	ERC2	O15083	957 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.25	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	ADD2	P35612	726 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	FSTL1	Q12841	308 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.24	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PRKAB2	O43741	272 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MBD4	O95243	580 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477		M0R2C6	588 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	IL25	Q9H293	177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MLH1-222	ENST00000539477	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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