RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538758.1

RIMKLB-208, Transcript of ribosomal modification protein rimK like family member B, human

TSL 3

Gene RIMKLB, Length 570 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RIMKLB-208	ENST00000538758	CACNB3	P54284	484 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	GSTO1	P78417	241 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	RASA3	Q14644	834 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	MX1	P20591	662 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	CYP7A1	P22680	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	BTD	P43251	543 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	RHBDL3	P58872	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	ERC2	O15083	957 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	PDE1A	P54750	535 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPP4C	P60510	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	NFIA	Q12857	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RIMKLB-208	ENST00000538758	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	BAG3	O95817	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	CHGB	P05060	677 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	PDE6A	P16499	860 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	TNNI2	P48788	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	TCP10	Q12799	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	NEFL	P07196	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	PDE4A	P27815	886 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	ADD2	P35612	726 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	RGS3	P49796	1198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRKG1	Q13976	671 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	ENTPD3	O75355	529 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	NF2	P35240	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63	1e-12	■■□□□ 13.5
RIMKLB-208	ENST00000538758	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	PLCG2	P16885	1265 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	HUNK	P57058	714 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	FKBP1B	P68106	108 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RIMKLB-208	ENST00000538758	PICALM	Q13492	652 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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