RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF20Q5VTR2 975 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 ALX1Q15699 326 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 HAND2P61296 217 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 DACT2Q5SW24 774 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 GPC2Q8N158 579 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 IGSF3O75054 1194 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 NBPF3Q9H094 633 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 F8W031 263 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMD14O00487 310 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 BECN1Q14457 450 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 GNAT2P19087 354 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 GSTO1P78417 241 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC14Q96N46 770 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 GLTPD2A6NH11 291 aa26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 PSME4Q14997 1843 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 E7EWF7 191 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP4CP60510 307 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 RUFY3Q7L099 469 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 HSCBQ8IWL3 235 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM22K7EJ46 135 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 LDHCP07864 332 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF213O14771 459 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 ST18O60284 1047 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 SCNN1DP51172 638 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 GAKO14976 1311 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 NEK1Q96PY6 1258 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 NAPBQ9H115 298 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 INCENPQ9NQS7 918 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMA5P28066 241 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT32Q14532 448 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 ZMYM6O95789 1325 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 BTDP43251 543 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 DPF2Q92785 391 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS6KB1P23443 525 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 TDO2P48775 406 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-209ENST00000532457 MMP14P50281 582 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 AK2P54819 239 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 RHBDL3P58872 404 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 EVX2Q03828 476 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 BAG3O95817 575 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CTR9Q6PD62 1173 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 OGFOD1Q8N543 542 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 LAMA4Q16363 1823 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 SLF2Q8IX21 1173 aa26.05■■□□□ 1.76
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