RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC172P0C7W6 258 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 CDC25BP30305 580 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 CTSWP56202 376 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 HSPA4P34932 840 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 EYA3Q99504 573 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 AKAP2Q9Y2D5 859 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 ST3GAL1Q11201 340 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 ELP1O95163 1332 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 SUCLG2Q96I99 432 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 BBOX1O75936 387 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV5-2P06315 115 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 NECAB1Q8N987 351 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 CARD6Q9BX69 1037 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 CHRNA5P30532 468 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 FAM212AQ96EL1 285 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC5A1P13866 664 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRPS1-211ENST00000520276 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-211ENST00000520276 TMC4Q7Z404 712 aa11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SARM1Q6SZW1 724 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 H7C1W4 665 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 NBPF11Q86T75 865 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SYNE4Q8N205 404 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 IQUBQ8NA54 791 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-211ENST00000520276 UFL1O94874 794 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 IL15P40933 162 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ATP8B2P98198 1209 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 DDR1Q08345 913 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 ADCY9O60503 1353 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 C21orf2O43822 256 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 TTC39AQ5SRH9 613 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 KCND1Q9NSA2 647 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-211ENST00000520276 GRIN3BO60391 1043 aa11.63□□□□□ -0.55
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